Jedes Individuum, das der Sammlung einverleibt wird, enthält eine Inventarnummer. Das erste Acquisitions- verzeichnis der
Sammlung stammt aus dem Jahre 1806, viele Belege datieren jedoch noch aus früherer Zeit.
In der wissenschaftlichen Literatur werden Sammlungsbestände mit dem Akronym NMW (für Naturhistorisches Museum Wien) gekennzeichnet. Die Sammlung enthält Säugetiere aus der ganzen Welt, wobei palaearktische Arten am besten vertreten sind.
Die Sammlung besteht aus Skeletten, Fellen, Bälgen und Dermoplastiken sowie Alkoholpräparaten. Von den Skeletten wurden häufig nur Schädel aufbewahrt, weil diese bei Säugetieren die wichtigsten Bestimmungsmerkmale tragen. Bei Bälgen handelt es sich um Fellpräparate für den wissenschaftlichen Gebrauch. Dermoplastiken (früher "Stopfpräparate") sind hingegen künstlerische Präparate für Schauzwecke. Sie zeigen das Tier in einer möglichst natürlichen Haltung und Bewegungsweise.
Die Sammlung von in Alkohol konservierten Säugetieren ist nur klein, wird jedoch im Hinblick darauf, dass aus alkoholkonservierten Exemplaren viel leichter DNA für genetische Studien zu gewinnen ist als aus Trockenpräparaten, in neuerer Zeit zügig ausgebaut.
Studienbälge, Schädel und der Großteil der Skelette sind in den Arbeitsräumen in metallenen Schrankanlagen in systematischer
Ordnung untergebracht. Dermoplastiken, so ferne sie nicht in der öffentlich zugänglichen Schausammlung sind, und Felle befinden
sich im klimatisierten Tiefspeicher. Hier werden aus konservatorischen Gründen die besonders wertvollen Präparate ausgestorbener
Säugetierarten (Blaubock, Quagga, Beutelwolf, Syrischer Onager, Somali-Wildesel) aufbewahrt. Montierte Skelette, Geweihe und
Walschädel und -skelette befinden sich aus Platzgründen in adaptierten Kellerräumen.
Einen umfangreichen Sammlungsschwerpunkt bildet holozänes Säugetiermaterial, das in Höhlen vom Boden aufgesammelt wurde. Es stellt die wichtigste in Österreich existierende Quelle für das Studium der faunengeschichtlichen Entwicklung der Säugetierfauna der Ostalpen nach der Eiszeit bis zur Gegenwart dar. Das Material wurde hauptsächlich von österreichischen Höhlenforschern gesammelt.
Die wissenschaftliche Sammlung ist für interessierte Personen nach schriftlicher oder telefonischer Voranmeldung zugänglich.
Blaubock, Hippotragus leucophaeus, Südafrika. Gilt als erstes afrikanisches Säugetier, das in der Neuzeit ausgerottet wurde
(um 1800). Unser Exemplar ist das einzige Weibchen unter den vier weltweit existierenden Dermoplastiken.
Bälge, Schädel/Skelette kleiner Säugetiere samt zugehörigen Karteikarten.
Geweihsammlung.
Metallschränke zur Aufbewahrung von Studienbälgen kleiner bis mittelgroßer Säugetiere.
Dermoplastiken im klimatisierten Tiefspeicher.
